方法学与研究工具
单细胞测序、空间转录组、多组学整合与衰老时钟方法学。方法学进步往往是结论可靠性的前提。
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← 返回专辑索引The average age was 53 years, and the CVD hospitalization incidence within 10 years was 6.7%, with men (8.0%) having a higher rate…
综述文献显示研究正从局部特征归因转向生成式、解纠缠、基于注意力与具有解剖学意义的表征。但解释结果仍对方法学与影像相关因素敏感,而脑龄差(BAG)还受年龄依赖性、校准、参照人群构成与站点异质性影响。未来研究应强调标准化评估与前瞻性临床验证,以开发可靠且具有临床意…
NFP-gal 性能合格,可用于荧光导向筛选;筛得天然 β-gal 抑制剂(IC₅₀ 约 25 μM 量级,与实测一致);抑制 β-gal 可削弱衰老细胞的 SASP 促炎放大效应,进而干预单核细胞招募、泡沫细胞形成与细胞外基质重塑,延缓动脉粥样硬化。
在同一批人的配对血浆-组织数据(178 人、5,415 个蛋白;配对血浆-肌肉 56 对、血浆-卵巢 24 对)中证明:血浆只选择性反映组织蛋白丰度(仅 50 个肌肉蛋白、17 个卵巢蛋白显著相关),且衰老相关的蛋白与通路在性别与组织层之间完全不同——血浆是组…
杂合性缺失(LOH)是一种与衰老与肿瘤发生均相关的体细胞基因组改变,会消除杂合缓冲、暴露有害隐性等位基因。本文提出 k 段约束隐马尔可夫模型,显式限制状态转移最大次数,以在稀疏单细胞 WGS 中稳健推断 LOH。
在芬兰双胞胎队列 2,508 人 + Young Finns Study 1,715 人(合计 4,223 人)中,偏离自身遗传预测 BMI 的方向决定了不同的分子签名:BMI 高于遗传预测时,炎症与心血管标志物的关联更强;BMI 低于遗传预测时,代谢物、蛋白…
n=122 例 ≥60 岁大手术患者的前瞻队列中,术后第 1 天 CRP 每翻一倍,谵妄发生比值比 OR=2.08(95% CrI [1.31, 3.63],P(OR>1)>0.99),校正后 OR=2.10([1.26, 3.90]);而术前 CRP 与谵妄…
建立 MSCProfiler 单细胞图像管线,用人牙髓来源 MSC(hDPSCs)跨早 / 中 / 晚代次整合明场形态特征(细胞大小、形状、偏心率)与 SA-β-gal 荧光信号来量化点状形态,目标是给异体移植前 MSC 的生物状态做一个可量化的质控工具。
用多物理场 agent-based 模型分析 PolG 早老小鼠的体内 micro-CT,量化出:归一化小梁厚度与成骨/破骨细胞数比值(Ob.N/Oc.N)的正相关在老年组明显强于年轻组(R²=0.58/0.61 vs 0.06/0.27),提示衰老期骨重建动…
脊髓延髓肌萎缩(SBMA)是 X 连锁神经退行病,由 AR 基因 CAG 重复扩增产生毒性多聚谷氨酰胺(polyQ)蛋白,属 polyQ 病,无改变疾病的疗法。SUMO 化等翻译后修饰调控 AR 的转录活性、稳定性与定位;本文靶向 SUMO 位点突变以改善毒性…
鉴定出多个候选变异,包括 Cic 基因 C1412Y substitution(位于高度保守区,无法被 Bbx 旁系同源物功能补偿,可能损害 Cic 功能)、Gsta6 表达降低(削弱谷胱甘肽依赖的自由基清除,削弱神经元与光感受器抗氧化防御)、Bfsp1 错义…
帝国理工团队用 STITCH 化合物-蛋白互作特征在 C. elegans 上做延寿化合物分类,XGBoost 最高准确率 80.36%、AUROC 0.7605;但真正该盯的数字是 AUPRC 仅 0.52–0.53,且解释方法会随特征表示而变。
曼彻斯特大学团队在 ADNI 上把 AT(N) 拆成五类任务分别评估:血浆 p-tau217 对 A 轴和 T 轴表现优异(AUROC 0.94 量级),但在 A+ 人群内部判别 T 阳性(0.8852)与 MRI 定义的神经变性 N 轴(0.7865)明显下…
用母体低磷饮食这一「非基因」手段,绕过 α-Klotho 缺陷大鼠的早期死亡与繁殖障碍,把断奶存活率从 85.8% 提到 92.6%,并把该经典早老模型维持到至少第五代。
Bar-Ilan 与哈佛团队用深度学习模型 DKO 对人、鼠、果蝇、线虫 45 个组织-细胞类型做虚拟敲除,发现随龄增加,同一个基因被扰动后的转录后果在细胞间越来越不一致(41/45 上升,40 项显著);突变负荷越高、衰老分数越高的细胞,偏离越大。这是把「转…
荷兰 Tilburg 大学团队用 84 种流水线组合(4 模态 × 3 图谱 × 7 校正)在 CamCAN 560 名健康成人上预测脑龄,MAE 从 5.26 到 18.30 岁。模态与偏倚校正显著影响精度,图谱选择不影响精度但决定「哪些连接最重要」——后者…
横断面(个体间)与纵向(个体内)设计得出的"随龄变化的遗传效应",其方向一致率高达 84.21%,但效应量仅有中度相关(Pearson r=0.51);差异的最大来源是基因×出生年队列的混杂(占方差 70.8%),其次为参与偏倚(11.6%…
自然衰老小鼠的五大衰弱评估工具(衰弱指数 / 衰弱表型 / 体能-活力评分 / 社会衰弱指数 / 认知衰弱指数)捕捉的是互补而非冗余的衰弱侧面,它们在"依赖主观观察程度、队列特异阈值、测试条件、以及跨性别/品系/实验室/结局的可重复性"上差…
在 687 名中国高龄老人(中位 79.6 岁)中,累积肥胖暴露(cBMI 与 cWC,即"超出阈值的幅度 × 持续年数")与生物学年龄(KDM-BA)和生理失调(PD)均呈正相关,而基线单次肥胖状态只与 KDM-BA 相关、与 PD 无关…
发布了 LivAge——一个准确、易取、开箱即用的小鼠转录组时钟,用肝脏 RNA-seq 数据即可给出稳健的年龄预测;应用到加速衰老模型可检出转录组年龄加速,为筛选 geroprotective 干预提供了小鼠侧的量尺。
在含 29 名九十岁老人、28 名百岁老人、29 名中年后代对照的 86 例队列中,血浆游离核酸呈现明显的非线性、-fragment-specific 且性别依赖的轨迹——核 cfDNA 从对照到九十岁显著下降(男性显著)却在百岁组略回升,而 cfmRNA 与…
Berlett 与 Stadtman 1997 年发表于 JBC 的综述:蛋白质氧化修饰(尤其是羰基化)随龄累积,而降解系统对氧化蛋白的清除效率随龄下降,二者共同构成蛋白稳态丧失的分子基础。这是把氧化应激与蛋白稳态两条研究线焊在一起的关键论述。
用 GBD 数据把疾病按生命周期影响重新聚类后,"衰老相关疾病"已是当前全球疾病负担的最大部分,且具备两个特殊性质:死亡率与患病率紧密耦合、以及边际收益递增(患病率越低,进一步收益越划算)。
在造血系统中,细胞外囊泡(EV)是骨髓 niche 与 HSPC 之间的主要通讯货币;衰老时 EV 的生物发生与 cargo 被重塑(尤其源自衰老 MSC 与成骨细胞的 EV 呈现miRNA 谱改变、抗氧化保护物减少),从而在受者细胞中诱导衰老、并推动髓系偏斜…