衰老与 SASP 基因名单散在四套资源里,ID 体系互不兼容,是做富集分析时最现实的摩擦。这份工作把它们统一到了 Ensembl ID,并补了三层注释。
卡片事实
| 要素 | 内容 |
|---|---|
| 来源平台 | arXiv q-bio(预印本,未同行评审) |
| 速递期次 | 2026-09-15 |
| 上线日期 | 提交 2026-09-10 · announce 2026-09-15 |
| 研究类型 | 工具与数据库 |
| 作者 | Hao Xuan; Yu Huang; Jiang Bian |
| DOI | 10.48550/arXiv.2609.13322 |
| 关键词 | 基因集 / SenMayo / CellAge / GenAge / Reactome / IL6 / JUN |
这项研究说了什么
- 把 CellAge、GenAge、SenMayo signature、Reactome Cellular Senescence 四源统一至 Ensembl gene ID
- 1460 条原始条目去重后得 1250 个唯一基因(去冗余 210 条,14.4%)
- 仅 IL6、JUN 被全部四源支持
- 三层注释覆盖率 95.8%/97.9%/93.0%,89.4% 基因三层齐备
- HGNC 精确匹配率 98.0%
整合四大衰老/SASP 基因资源为统一 Ensembl ID 数据库,新增保守性、表达与互作三层注释
为什么值得看
可直接用于 senescence / SASP 基因集分析与 senolytics 靶点筛选的基础设施
需要保留的意见
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- 口径分歧:提交日 2026-09-10 早于窗口,announce 日 2026-09-15 落窗,原始速递按 announce 日收录并已显式标注;摘要层面未见外部验证
- 卡片未给出样本量、效应量与统计细节处均标待补全文,本文不补充任何总表之外的定量;
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