工具方法

SenSASP:统一的衰老与 SASP 基因多层数据库

来源:arXiv q-bio 预印本(未同行评审) · DOI 10.48550/arXiv.2609.13322 · 来源=文献层「预印本速递」统一总表 · 交叉判定=C(预印本·观点·机构披露)· 待补全文

衰老与 SASP 基因名单散在四套资源里,ID 体系互不兼容,是做富集分析时最现实的摩擦。这份工作把它们统一到了 Ensembl ID,并补了三层注释。

卡片事实

要素内容
来源平台arXiv q-bio(预印本,未同行评审)
速递期次2026-09-15
上线日期提交 2026-09-10 · announce 2026-09-15
研究类型工具与数据库
作者Hao Xuan; Yu Huang; Jiang Bian
DOI10.48550/arXiv.2609.13322
关键词基因集 / SenMayo / CellAge / GenAge / Reactome / IL6 / JUN

这项研究说了什么

  • 把 CellAge、GenAge、SenMayo signature、Reactome Cellular Senescence 四源统一至 Ensembl gene ID
  • 1460 条原始条目去重后得 1250 个唯一基因(去冗余 210 条,14.4%)
  • 仅 IL6、JUN 被全部四源支持
  • 三层注释覆盖率 95.8%/97.9%/93.0%,89.4% 基因三层齐备
  • HGNC 精确匹配率 98.0%

整合四大衰老/SASP 基因资源为统一 Ensembl ID 数据库,新增保守性、表达与互作三层注释

为什么值得看

可直接用于 senescence / SASP 基因集分析与 senolytics 靶点筛选的基础设施

需要保留的意见

  • 预印本,未经同行评审——结论可能在正式发表时被修改或推翻;本站按等级 C记录,不作为实践依据;
  • 口径分歧:提交日 2026-09-10 早于窗口,announce 日 2026-09-15 落窗,原始速递按 announce 日收录并已显式标注;摘要层面未见外部验证
  • 卡片未给出样本量、效应量与统计细节处均标待补全文,本文不补充任何总表之外的定量;

关于本文的 C 级标注

本站 C 级覆盖三类内容:「预印本 / 观点评论 / 机构披露」。本文属于第一类——预印本:它是发表在 arXiv q-bio 上的一份原始研究报告(工具与数据库),只是尚未通过同行评审,并非观点或评论文章。文末提示框沿用全站统一模板,其中「非原始研究」一句不适用于本文,特此说明。

本文内容依据「预印本速递」统一总表与预印本平台公开摘要撰写;付费墙与未获取全文之处一律标注待补全文,未做任何数值推算补全。

C 级证据分级:C 级(预印本 / 观点评论,非原始研究)

本文属观点/评论类文献,不是原始研究。其论点依赖于作者对既有证据的梳理与判断,不构成新的实验证据。本站标注 C 级即为此意——阅读时请把它当作「领域内的思考框架」,而非「研究发现」。

关于本文的文献来源:本站依据 IMA 知识库「五刊监控·深度文献卡片」(SOP §4.2 摘要级)撰写,依据期刊公开摘要与 PubMed 元数据;付费墙全文未获取之处已标注「待补全文」,未做任何数值推算补全。