工具方法

可扩展的细胞核形态计算表型组学

来源:bioRxiv 预印本(未同行评审) · DOI 10.64898/2026.09.17.752335 · 来源=文献层「预印本速递」统一总表 · 交叉判定=C(预印本·观点·机构披露)· 待补全文

最便宜的老化读数可能就藏在日常 H&E 切片里。这份工作把核形态做成了 129 维可解释特征,并据此给出了皮肤老化的终生速率轨迹。

卡片事实

要素内容
来源平台bioRxiv(预印本,未同行评审)
速递期次2026-09-24
上线日期created 2026-09-23 18:50:11Z(CST 09-24 02:50)· bioRxiv posted 2026-09-23
研究类型计算与建模(工具)
作者Duari, S.; Shome, R.; Raza, A.; Solanki, S.; Satija, S.; Sinha, S.; Kumar, S.; Chauhan, S.; Sharma, A.; Gautam, V.; Gupta, M.; Sengupta, D.; Ahuja, G.(13 人)
DOI10.64898/2026.09.17.752335
关键词数字病理 / 核形态 / 可解释特征 / 衰老轨迹 / 神经ODE / 皮肤光老化

这项研究说了什么

  • NucXplore 把每个 H&E 细胞核转成 129 个显式定义特征(形态、染色质、强度、纹理、颜色、空间上下文)
  • Rust 实现较 Python 参考加速 17.6 倍
  • 在三个组织病理队列上优于经典描述子与更大的深度嵌入,且保留特征归因
  • 用于人皮肤时,层次多示例模型解析出 8 个细胞区室并解码年龄与日晒状态,显示「大体共享的老化程序 + 年龄与细胞特异的曝光依赖重校准」
  • 用条件流匹配与神经 ODE 把横断面表型转为模型推断轨迹,发现中年速率最低、晚年再加速,且轨迹幅度与方向具细胞特异性
  • 无源域适应实现向独立医院队列的初步迁移

H&E 切片核形态 129 维可解释特征可解码皮肤老化程序,并给出终生速率轨迹(中年最慢、晚年再加速)

为什么值得看

提供「用现成病理切片做衰老生物标志物」的低成本路径,且特征可解释(可定位到具体核特征);中年速率最低-晚年再加速的轨迹形态可与表观时钟结论对读

需要保留的意见

  • 预印本,未经同行评审——结论可能在正式发表时被修改或推翻;本站按等级 C记录,不作为实践依据;
  • 年龄状态系「从常规病理切片解码」,非纵向随访,轨迹为模型推断而非实测;队列来源与样本量未在摘要给出;「晚年再加速」等轨迹结论需独立数据复现;溯源:本期 bioRxiv 官方 details API 对全区间返回空响应(判定 openRxiv 迁移后不可用),本条为 Crossref 单源,标题/作者/单位/通讯作者已用 bioRxiv 网页元数据逐项核对
  • 卡片未给出样本量、效应量与统计细节处均标待补全文,本文不补充任何总表之外的定量;

关于本文的 C 级标注

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